La historia se centra en Akihisa Yoshii, el baka; del título. Su academia divide rígidamente el cuerpo estudiantil en clases basadas en los resultados de los exámenes. Los prodigios están en la clase A con asientos reclinables completos con aire acondicionado, pero Akihisa está en la clase F, el peldaño más bajo de la escalera de la escuela que está amueblado solo con mesas bajas y decrépitas y tatamis de paja desgastados. Una niña llamada Mizuki Himeji es en realidad una de las chicas más inteligentes en el segundo año de Akihisa, pero tenía fiebre el día del examen y fue encasillada en la clase F. Además de Mizuki (a quien Akihisa adora en secreto), la clase F también tiene a Yuuji Sakamoto, el presidente de la clase que ha sido amigo y compañero en el crimen de Akihisa desde el primer año. Resulta que la escuela ha desarrollado experimentos para invocar criaturas fantásticas, y Akihisa decide reunir a la clase F para tomar clases de nivel superior y aprovechar sus vent