Gunbuster es la historia de Noriko Takaya, una joven que está tratando de seguir los pasos de su famoso padre, el Almirante Yuzo Takaya. Narra las pruebas y amarguras de Noriko mientras lucha porconvertirse en piloto del enorme robot Gunbuster. Con la ayuda de su entrenador Ota y sus amigos Kazumi y Jung, Noriko conquista sus miedos y aprende una de las lecciones más importantes en la vida: Creer en uno mismo.