Kurokami Medaka es un estudiante excepcional de primer año en la Academia Hanokiwa que fue elegido presidente del consejo estudiantil con un aplastante 98% de los votos. Extremadamente inteligente, fuerte y rico; quiere ayudar a quien lo necesite. Para ello, introduce un buzón de sugerencias que permite que cualquier alumno se ponga en contacto con ella. Más tarde, conocida como la Caja Medaka, traerá desafíos increíbles para Kurokami y sus amigos del consejo estudiantil.