¡El desventurado héroe de Nyankoi! es Junpei Kosaka, un tipo que no solo odia a los gatos, sino que es mortalmente alérgico a ellos. Así que es un poco fastidioso que esté enamorado de una compañera de clase que adora a los gatitos, y las cosas van de mal en peor cuando accidentalmente enoja a una deidad guardiana de los gatos que le otorga un regalo y una maldición. Ahora puede entender lo que dicen los gatos, pero debe conceder 100 deseos de los gatos o ¡él mismo se convertirá en un gato!