Daisuke Doujima es un estudiante que estuvo secuestrado cuando era un niño. Ahora, Daisuke y sus amigos están implicados en uno de los extraños acontecimientos denominados "El traslado de Shibuya", por el cual viajan, junto a la población del distrito, 300 años al futuro. Allí tendrán que enfrentarse a unos monstruos conocidos como civils, quedando en el medio del conflicto entre unas enigmáticas organizaciones "Ra" y "Revision". Juntos intentarán sobrevivir y recuperar su presente.