Un joven niño llamado Shinta es salvado por Hiko Seijuro y dado el nombre de Kenshin. El entrena a Kenshin en el camino de Hiten Mitsurugi Ryuu, una tecnica de espada sin rival. Como la guerra civil se intensifica, el joven Kenshin siente que su deber es ayudar a salvar personas. Lo que hace convertirse en el mas temido Hitokiri Battousai.