En el año 298 de la Era Divina, las niñas de la primaria Shinju: Washio Sumi, Nogi Sonoko y Minowa Gin son escogidas para llevar a cabo un importante deber. Las tres han de convertirse en Heroínas y luchar contra los Vertex, unos misteriosos enemigos que buscan destruir a Shinju-sama, el Árbol Sagrado que protege Shikoku, la única zona del mundo que todavía es habitable. Lo que ellas no saben, es que esta lucha será más difícil de lo que podrían haber imaginado.