Dos años antes de los acontecimientos de la primera temporada,​ tres chicas de primaria reciben la misión de encargarse de los ataques de los Vertex que se están produciendo en el Jukai. Sin embargo, este grupo formado por Washio Sumi, Nogi Sonoko y Minowa Gin aún es demasiado inexperto e inseguro. Así pues, después de la primera batalla, las tres se deciden en arreglar sus problemas de trabajo en equipo y en mejorar sus capacidades de combate.