Shinobu es una aprendiz de ninja que esta intentando aprobar un examen. Kaede es una chica normal que se encuentra estudiando. Sus caminos se cruzan cuando Shinobu intenta colarse en la habitación de Kaede y robar sus braguitas como parte del examen asignado por su maestro. Shinobu no es una ninja muy buena, y Kaede la pilla robando, deteniéndola poco tiempo después. Cuando Shinobu empieza a llorar por haber fallado en su cometido, Kaede decide prestarle su par de braguitas, dando lugar a una nueva amistad y a una vida llena de locas aventuras junto a su amigo Onsokomaru y los demás ninjas de la academia.