En esta nueva temporada, que es continuación directa de la anterior, Tomoya y Nagisa encaran su último semestre en la escuela para graduarse y lanzarse de lleno al mundo adulto. Incapaz de decidir sobre su futuro, Tomoya aprenderá sobre el valor del trabajo duro y el compañerismo mientras comprende la importancia del fuerte apoyo por parte de Nagisa. Juntos, avanzarán por un camino que les llevará a enfrentarse a los fantasmas del pasado, así como reforzar sus viejas relaciones y formar lazos nuevos.