Segunda Temporada. La historia está ambientada en un Siglo XXI alternativo en el cual el shogunato de Tokugawa nunca perdió su poder y mantuvo la unidad y el control de país hasta los tiempos actuales. El shogun en el poder es el número 25 ya y a los pies del Monte Fuji se encuentra una academia militar en la que se forman los hijos de los altos cargos del shogunato. Los protagonistas son en su mayoría descendientes de grandes familias guerreras históricas en Japón, con lo que entre ellos nos encontramos con una muchacha llamada Jubei Yagyu o un Hanzo Hattori.