En 1999 la batalla decisiva por la supervivencia de la humanidad se dará lugar en Tokio. Los “Dragones del Cielo”, defensores de la tierra, se quedarán para proteger el mundo de los “Dragones de la Tierra”, siete ángeles legendarios, los cuales desean la devastación del planeta para purificarlo. Kamui Shirou es quien tiene la ultima palabra deberá decidir de qué lado luchar pero encontrará la idea completamente desagradable. Ya que su único deseo será proteger a las personas que mas ama Fuuma y Kotori Monou, quienes desafortunada se verán involucrados forzando de este modo a Kamui a tomar una decisión.