La historia sigue a Muneakira Yagyu, un jóven que asiste a la Buou Academy , la cual es una academia de gigante situada en la base del Monte Fuji, donde las personas entrenan para ser guerreros samurai. Su vida da un repentino giro cuando conoce a Jubei Yagyu, una misteriosa chica que cayó del cielo desnuda que más tarde se convierte en su primera "Maestro Samurai" después de recibir un beso de ella.