Hyouka nos cuenta la historia de Oreki Houtarou y sus 3 amigos que pertenecen al Club de Literatura Clásica, donde la hermana de Houtarou solía pertenecer y por eso lo invitó a unirse a él, ya que al tener pocos miembros corría el riesgo de disolverse. Sin embargo, por más que el club se dedica a la literatura clásica, Houtarou y los otros miembros del club se dedicarán a resolver cualquier misterio que surja dentro o fuera de su escuela.