Lain una chica de 14 años de edad, algo tí­mida, sin amigos en el colegio, con una familia totalmente extraña. Ella vive muy cerrada, tanto que ni ella misma se conoce y que le interesa muy poco todo lo que le rodea, pero a partir de que Chisa Yomoda, una chica que se había suicidado, le manda un mail donde le dice que no ha muerto que solo había decidido liberarse de su cuerpo y agrega que aunque no comprenda lo que hizo después lo comprenderá ella y los demás, es cuando Lain se interesa en el mundo de los NAVI.