Si bien la misión final de Gunbuster destruyó el sistema estelar de los Monstruos Espaciales, la guerra intergaláctica aún continúa. La única esperanza de la Tierra está en manos de TOPLESS, un grupo de niños mecha de élite que posee poderes sobrenaturales y nuevas máquinas Buster. Entre sus filas se encuentra una novata llamada Nono y la piloto as Lal'C, a quien Nono ve como una "hermana mayor". Junto con sus compañeros de equipo Nicola y Casio, deben hacer todo lo posible para proteger a toda la humanidad de la ira de los monstruos espaciales.