La historia de Zettai Bōei Leviathan se centra en la tierra de Aquafall, la cual sufre el impacto de varios meteoritos los cuales ponen en peligro la existencia de los habitantes del planeta. El hada Syrup reunirá las Fuerzas de Defensa de Aquafall en la figura de tres chicas del Clan Dragon: Leviathan, Bahamut, y Jörmungandr. Juntas trabajaran para luchar contra los enemigos que amenazan la paz de Aquafall.